Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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