Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms