Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms