Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm2P58774 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms