Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcstnP57716 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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NcstnP57716 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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