Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmoP56726 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmoP56726 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmoP56726 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SmoP56726 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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