Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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