Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp5bP56480 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5bP56480 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms