Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms