Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp5P56399 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms