Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms