Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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