Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RabggtbP53612 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RabggtbP53612 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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RabggtbP53612 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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RabggtbP53612 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RabggtbP53612 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RabggtbP53612 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RabggtbP53612 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RabggtbP53612 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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RabggtbP53612 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RabggtbP53612 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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