Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Upp1P52624 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms