Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms