Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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