Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbrP50284 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbrP50284 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms