Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tmod1P49813 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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