Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrprbP47758 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrprbP47758 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrprbP47758 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms