Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syt1P46096 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syt1P46096 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms