Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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