Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx1-2P42580 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms