Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms