Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PpardP35396 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpardP35396 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms