Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab20P35295 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab20P35295 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms