Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms