Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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