Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms