Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VtnP29788 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VtnP29788 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VtnP29788 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VtnP29788 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms