Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif5cP28738 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms