Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms