Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxraP28700 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxraP28700 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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