Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BgnP28653 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BgnP28653 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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