Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Hoxd10P28359 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hoxd10P28359 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hoxd10P28359 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hoxd10P28359 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd10P28359 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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