Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms