Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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