Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CftrP26361 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CftrP26361 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CftrP26361 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CftrP26361 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CftrP26361 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms