Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms