Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HdcP23738 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HdcP23738 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HdcP23738 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HdcP23738 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms