Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms