Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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