Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkchP23298 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkchP23298 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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