Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms