Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pou3f1P21952 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou3f1P21952 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms