Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpcP21841 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SftpcP21841 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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