Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms