Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb9P20615 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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