Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms