Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TP20293 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TP20293 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TP20293 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TP20293 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TP20293 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TP20293 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TP20293 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TP20293 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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TP20293 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TP20293 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TP20293 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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TP20293 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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TP20293 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TP20293 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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TP20293 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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