Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou5f1P20263 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms